با وجود رشد در عملکرد شورای عالی مناطق آزاد مطرح شد
بهینهسازی برنامهای، شفافیت و دوری از هرگونه حاشیهسازی
مناطق آزاد تجاری-صنعتی ایران به دلیل ماهیت متفاوت منابع مالی و بودجهای نمایندگان دولت (سازمانهای مناطق و بهتبع آن دبیرخانه شورایعالی)، اساس و مدل روابط نهاد دولت با مردم و بخش خصوصی متفاوت است. مناطق آزاد علیرغم داشتن پتانسیل درآمدزایی از طریق ترانزیت کالا و گردشگری که به اذعان کارشناسان رشد داشته است، اما برخی همچنان معتقدند که شورای عالی این مناطق نیازمند برنامههای گسترده تری برای بهرهبرداری از منابع این مناطق است.